Das Institut für Informationssysteme ist die zentrale Forschungseinrichtung der Informatik an der Hochschule Hof. Es wird mit Mitteln des Freistaates Bayern, der Oberfrankenstiftung und der Europäischen Union finanziert. Die Forschungsarbeiten des Instituts konzentrieren sich aktuell auf integrierte Informationssysteme zur Unterstützung betrieblicher Geschäftsprozesse. Für die Integration werden drei Dimensionen untersucht:Die vertikale Integration betrachtet die Kopplung von Informationssystemen von der strategischen bis hin zur operativen Ebene.Die horizontale Integration untersucht die Verbindung von Informationssystemen auf der gleichen Ebene innerhalb eines sowie zwischen unterschiedlichen Unternehmen.Die Datenintegration entwickelt Methoden zur einheitlichen Verwaltung von unterschiedlichen Datentypen wie unstrukturierten Texten und strukturierten relationalen und räumlichen Daten.